MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisB5 chromosome

Total Repeats: 13948

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007958	GGT	2	6	24	29	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007958	TTC	2	6	64	69	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_007958	GGGC	2	8	94	101	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4	NC_007958	CGG	3	9	110	118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_007958	GGC	2	6	129	134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_007958	GC	3	6	248	253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_007958	GAC	2	6	273	278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007958	GAC	2	6	315	320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_007958	ATT	2	6	413	418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007958	ATC	2	6	436	441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_007958	CCTGA	2	10	515	524	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_007958	CGC	2	6	575	580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_007958	GCG	2	6	584	589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_007958	GCT	2	6	640	645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_007958	CGGC	2	8	2090	2097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_007958	CCG	2	6	2101	2106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_007958	TCT	2	6	2118	2123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_007958	ACCC	2	8	2159	2166	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
19	NC_007958	CCG	2	6	2173	2178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_007958	C	6	6	2201	2206	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
21	NC_007958	ACC	2	6	3467	3472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_007958	CGT	2	6	3473	3478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_007958	TTC	2	6	4866	4871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_007958	CGATT	2	10	4954	4963	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_007958	GTTG	2	8	7527	7534	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007958	CAT	2	6	7559	7564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_007958	CGG	2	6	7604	7609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_007958	GCG	2	6	7672	7677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_007958	CAT	2	6	7685	7690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_007958	GCCCA	2	10	9114	9123	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
31	NC_007958	CG	3	6	9134	9139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_007958	AG	3	6	9191	9196	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007958	AG	3	6	9202	9207	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007958	GTC	2	6	9224	9229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_007958	CGC	2	6	9236	9241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_007958	TCC	2	6	10564	10569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_007958	CCT	2	6	10607	10612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_007958	TCCG	2	8	10652	10659	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_007958	GTCG	2	8	10670	10677	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_007958	AGT	3	9	10688	10696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007958	GCT	2	6	10769	10774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_007958	GCCG	2	8	10807	10814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_007958	TGG	2	6	10835	10840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007958	GGA	2	6	10859	10864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007958	GCTT	2	8	22525	22532	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_007958	GCC	2	6	22538	22543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_007958	CTG	2	6	22831	22836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_007958	CGA	2	6	22854	22859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_007958	CCA	2	6	22897	22902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_007958	GCG	2	6	23611	23616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007958	CCGGC	2	10	23636	23645	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
52	NC_007958	GAG	2	6	23700	23705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007958	GAC	3	9	23712	23720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_007958	CGC	2	6	23729	23734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_007958	GAT	2	6	23735	23740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007958	GAC	2	6	23760	23765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_007958	GAC	2	6	24606	24611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_007958	GAC	2	6	27737	27742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_007958	ATCG	2	8	27754	27761	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_007958	ACT	2	6	27779	27784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_007958	GATC	2	8	27787	27794	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_007958	GCC	3	9	28413	28421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_007958	CGA	2	6	28465	28470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_007958	CGG	2	6	28578	28583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_007958	GGC	2	6	28610	28615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_007958	GCC	2	6	28654	28659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_007958	GC	4	8	28663	28670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_007958	GTC	2	6	28681	28686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_007958	GCG	2	6	28748	28753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_007958	CGA	2	6	28760	28765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_007958	GC	4	8	28786	28793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_007958	CGA	2	6	28806	28811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_007958	GA	3	6	28810	28815	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007958	CG	3	6	29275	29280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_007958	GAA	2	6	29284	29289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007958	G	6	6	29300	29305	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007958	CTA	2	6	37244	37249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_007958	CCT	2	6	41927	41932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_007958	TGA	2	6	42127	42132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007958	AT	3	6	42166	42171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007958	TGAC	2	8	42241	42248	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_007958	CTC	2	6	49809	49814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_007958	ATG	2	6	49834	49839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007958	C	6	6	49853	49858	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
85	NC_007958	CAT	2	6	49884	49889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_007958	TGA	2	6	49960	49965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007958	TGAT	2	8	49980	49987	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007958	GGA	2	6	49990	49995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007958	TGG	2	6	50233	50238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007958	C	6	6	50260	50265	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
91	NC_007958	CAA	2	6	50268	50273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_007958	TCC	2	6	50282	50287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_007958	CCG	2	6	50297	50302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_007958	CGC	2	6	50306	50311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_007958	GCC	3	9	50327	50335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_007958	CCA	2	6	50349	50354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_007958	TTG	2	6	50400	50405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007958	GAA	2	6	53076	53081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007958	GTTC	2	8	53089	53096	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_007958	GCAG	2	8	53100	53107	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_007958	GC	3	6	53112	53117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_007958	CTT	2	6	55093	55098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_007958	GTC	2	6	55109	55114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_007958	GTTT	2	8	55154	55161	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007958	CGAA	2	8	55225	55232	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_007958	GAA	2	6	55907	55912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007958	GGGC	2	8	55972	55979	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
108	NC_007958	ATA	2	6	56008	56013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007958	AGC	2	6	56030	56035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_007958	TCA	2	6	56097	56102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_007958	AGG	2	6	56868	56873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007958	CTG	2	6	56890	56895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_007958	TGT	2	6	56897	56902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007958	GGA	2	6	56916	56921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007958	ACC	2	6	56965	56970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_007958	CGG	2	6	60243	60248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_007958	CGG	2	6	60275	60280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_007958	TCC	2	6	61543	61548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_007958	TCC	2	6	66536	66541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_007958	CGT	2	6	66552	66557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_007958	CGGCG	2	10	66574	66583	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
122	NC_007958	CGGGC	2	10	67904	67913	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
123	NC_007958	AGG	2	6	68013	68018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007958	ATG	2	6	69894	69899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007958	GAC	2	6	69916	69921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_007958	GC	4	8	70072	70079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_007958	T	7	7	71108	71114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007958	GC	3	6	73622	73627	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_007958	GCAG	2	8	73661	73668	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_007958	CTG	2	6	74695	74700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_007958	CGC	2	6	74705	74710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_007958	GC	3	6	74734	74739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_007958	CGC	2	6	74893	74898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_007958	CCT	2	6	74957	74962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_007958	ACC	2	6	74988	74993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_007958	GCG	2	6	74995	75000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_007958	CGACC	2	10	75005	75014	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
138	NC_007958	CA	3	6	75038	75043	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_007958	GTG	2	6	75161	75166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007958	CGT	2	6	75190	75195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_007958	CAAT	2	8	76234	76241	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_007958	GTT	2	6	76325	76330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007958	GCT	2	6	76394	76399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_007958	GCC	2	6	76405	76410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_007958	CAT	2	6	76424	76429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_007958	AATC	2	8	76480	76487	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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